如何看懂文献里那些图——热图(Heatmap)

在组学研究的相关文章中，我们常常可以看到热图（Heatmap）的展示。这些红绿相间且色彩变化丰富的热图总是能吸引读者的眼球，从而为文章增添不少亮色。有句话说得好，三分文章七分图，一幅精美的Figure在一篇文献中的地位举足轻重，所以，想要速读文献，抓住重点，就要练就一眼看懂图的本领。

热图作为一种对实验数据及其分析结果的直观的表达方式，在很多文章中都有着不可或缺的地位。今天就由小江来带大家一起来解读——热图（Heat map）

热图解读

热图是对实验数据进行质量控制和差异数据的展现，单个热图由热图主体和热图组件组成。

热图主体可以按行和列拆分，位于热图中央。

热图组件包括标题、树状图、矩阵名称和热图注释（热图注释以行列为划分进行注释，一般列注释对应其样本来源，行注释对应分子学类型），位于热图主体的四个侧面。

比如这幅图，要怎么看呢？我们先把它分成五部分：

① 就是它的横坐标，代表样本；

② 是它的纵坐标，代表基因，此外还表示红色代表高表达，绿色代表低表达；

③ 是它的主体部分，代表各个基因在样本中的表达情况；

④ 表示这些样本共分为了两类；

⑤ 是对这些基因表达模式的聚类分析的树形图。

所以这幅图要表达的意思是这 8 种基因在两类样本中的表达情况，大家可以直观的看到天蓝色的样本某些区域要比粉红色样本更红一些，也就是这些基因表达量更高一些。

这里又涉及了一个名词，聚类分析。简单地说就是把表达相似的基因归为一类，从而更有利于我们对结果进行观察分析。等以后分享到聚类分析图的时候再详细聊。

不仅仅可以表示表达量的差异，热图还可以表示相关性的高低等等，大家要注意纵坐标表示什么。

通过对数据进行这样的可视化处理以后，我们就可以很清楚的看到两类样本基因表达含量的差异性，从而帮助我们抓住研究重点，对差异性进行进一步的分析。

总结一下

热图：用颜色代表数字，让数据呈现更直观，对比更明显。

作用：

• 直观呈现多样本多个基因的全局表达量变化；
• 呈现多样本多基因表达量的聚类关系。

聚类：本质上是利用多组值间两两的差异程度或者相似程度作为依据，对多组值进行层吸聚类，以最终得到样本间聚类的远近关系。

作用：探讨样本（或基因）的表达量水平如何分类，以及相关关系。

热图绘制

在这里给大家分享一个简单易操作的生信工具——TBtools，比如热图，只需三步就能制作，还可以根据自己的需要进行美化，让图片看起来更美观。

根据自己的数据设置参数，调整高低、颜色、形状等。

工具地址：
https://github.com/CJ-Chen/TBtools/releases

热图的出现使的繁杂的数据分析结果更加清晰明了，我们可以轻易的从图中直接获得数据分析结果。把简单的热图应用的合适的文章中，也一定可以锦上添花！

文章来源于江莱生物（shjianglai666）